De Markgraf werd kort na het uitbreken van de 1e Wereldoorlog ingedeeld bij het derde slageskader van de Hochseeflotte en gestationeerd in Kiel. Ze nam deel aan de Slag voor het Skagerrak op 31 mei/1 juni 1916, waar ze vijfmaal werd geraakt door zwaar geschut; 11 man sneuvelden en 13 raakten gewond.
Ze werd gerepareerd bij AG Vulcan in Hamburg en sloot zich op 20 juli 1916 weer bij de vloot aan. Geïnterneerd in de Britse oorlogshaven Scapa Flow werd Markgraf op 21 juni 1919 door de eigen bemanning tot zinken gebracht. Het schip werd niet geborgen en pas in 1962 werd overgegaan tot sloop van het wrak. Aanzienlijke delen van de romp zijn echter nog op de zeebodem aanwezig.